Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Pkn3Q8K045 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Pkn3Q8K045 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Pkn3Q8K045 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Pkn3Q8K045 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Pkn3Q8K045 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Pkn3Q8K045 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Pkn3Q8K045 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Pkn3Q8K045 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Pkn3Q8K045 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Pkn3Q8K045 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkn3Q8K045 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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Pkn3Q8K045 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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