Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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