Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms