Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ephb1Q8CBF3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ephb1Q8CBF3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms