Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol7cQ8C6E1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms