Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q8C5C9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms