Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Znf428Q8C1M2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Znf428Q8C1M2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Znf428Q8C1M2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Znf428Q8C1M2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Znf428Q8C1M2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Znf428Q8C1M2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Znf428Q8C1M2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Znf428Q8C1M2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Znf428Q8C1M2 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms