Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms