Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms