Protein–RNA interactions for Protein: Q80WC9

Aasdh, Acyl-CoA synthetase family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AasdhQ80WC9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AasdhQ80WC9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms