Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ttc29Q80VM3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ttc29Q80VM3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ttc29Q80VM3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ttc29Q80VM3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ttc29Q80VM3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ttc29Q80VM3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ttc29Q80VM3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ttc29Q80VM3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ttc29Q80VM3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ttc29Q80VM3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ttc29Q80VM3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ttc29Q80VM3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ttc29Q80VM3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ttc29Q80VM3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms