Protein–RNA interactions for Protein: Q80VL3

Prickle3, Prickle planar cell polarity protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prickle3Q80VL3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prickle3Q80VL3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prickle3Q80VL3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prickle3Q80VL3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prickle3Q80VL3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prickle3Q80VL3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prickle3Q80VL3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prickle3Q80VL3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prickle3Q80VL3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prickle3Q80VL3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prickle3Q80VL3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prickle3Q80VL3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prickle3Q80VL3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prickle3Q80VL3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prickle3Q80VL3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prickle3Q80VL3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms