Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NischQ80TM9 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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