Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms