Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smap2Q7TN29 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smap2Q7TN29 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms