Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms