Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim12Q78RX3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim12Q78RX3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim12Q78RX3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim12Q78RX3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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