Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms