Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tmeff1Q6PFE7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tmeff1Q6PFE7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms