Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms