Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Pkp4Q68FH0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Pkp4Q68FH0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Pkp4Q68FH0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Pkp4Q68FH0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Pkp4Q68FH0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Pkp4Q68FH0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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