Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Polr2kQ63871 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms