Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrn1Q61809 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms