Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
AcanQ61282 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms