Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms