Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RelnQ60841 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RelnQ60841 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RelnQ60841 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RelnQ60841 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RelnQ60841 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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RelnQ60841 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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RelnQ60841 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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RelnQ60841 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RelnQ60841 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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