Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms