Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr2f1Q60632 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms