Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms