Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdc1Q5PSV9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms