Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm3Q5F4S9 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms