Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTM8

Rnf20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, mousemouse

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Length 973 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf20Q5DTM8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rnf20Q5DTM8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rnf20Q5DTM8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf20Q5DTM8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf20Q5DTM8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf20Q5DTM8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf20Q5DTM8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf20Q5DTM8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf20Q5DTM8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf20Q5DTM8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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