Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2C1

Krtap9-3, Keratin-associated protein 9-3, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap9-3Q3V2C1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Krtap9-3Q3V2C1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms