Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ccdc27Q3V036 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ccdc27Q3V036 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ccdc27Q3V036 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ccdc27Q3V036 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ccdc27Q3V036 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ccdc27Q3V036 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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