Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms