Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms