Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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