Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms