Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms