Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Nkx6-3Q3UHX8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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