Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDN3

Gm45902, Predicted gene 45902, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45902Q3UDN3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm45902Q3UDN3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm45902Q3UDN3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms