Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms