Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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