Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rpusd3Q14AI6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rpusd3Q14AI6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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