Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms