Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubxn2bQ0KL01 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms