Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NrepQ07475 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NrepQ07475 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms