Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms