Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms