Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Gm42698-201ENSMUST00000197790 762 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 D530037P16Rik-201ENSMUST00000199255 1027 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Gm45217-201ENSMUST00000206576 1026 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Siah2Q06986 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms